El Museo Municipal de Todi con su interesante pinacoteca, reorganizado y reabierto al público en 1997, se encuentra en el último piso del Palacio del Pueblo y del Palacio del Capitán. Organizado en secciones, la visita se abre con el Museo de la ciudad que ilustra los momentos más significativos en la historia de la ciudad de Todi, aquí están las famosas losas de mármol del siglo X-XI que representan a San Fortunato, San Casiano y al Cristo Redentor. Las siguientes cinco secciones están dedicadas a la arqueología (cerámica ática con figuras negras y rojas, terracota arquitectónica y bronces votivos), numismática (para un total de unas 1500 monedas desde la griega y prerromana hasta la medieval y moderna), tejidos (vestimentas sagradas y otros objetos de seda, terciopelo, damasco y lino realizados entre los siglos XV y XVIII), cerámica (cerámica de uso común entre los siglos VIII y XIII), y por último, pero no por ello menos importante del museo municipal de Todi, la Pinacoteca donde se conservan obras de arte como las admirables: el famoso retablo de Giovanni di Pietro, uno de los discípulos más importantes del Perugino, que representa la Coronación de la Virgen, seis lienzos de Ferraù de Faenza de la Catedral y de la iglesia de San Fortunato, la Deposición de Pietro Paolo Sensini (1608), y Virgen con el Niño y los Santos de Andrea Polinori.