Links neben dem Dom ist der 1593 vom Bischof Angelo Cesi in Auftrag gegebene Palazzo Vescovile di Todi über eine Treppe erreichbar. Er wurde an dem Ort errichtet, wo die Häuser der Domherren emporragten, und sollte zu einer würdigen Wohnung für einen Prinzen und Mäzen der Renaissance werden.
Palazzo Vescovile di Todi erstreckte sich über vier Stockwerke: Im unteren Stockwerk auf der Höhe des Gartens mit dem Namen „Orto del Vescovo“ („Bischofsgarten“), heute aufgelassen, befanden sich Küchen, Ställe, Keller und Lagerräume. Über den Haupteingang, der Vignola zugeordnet wird, erreichte man den ersten Stock, der die Kanzlei, das Büro und das Archiv beherbergte. Von diesem Stockwerk aus führte eine monumentale Treppe in das Hauptgeschoss, in dem sich die Sala del trono (Thronsaal) befand, die als Empfangsraum und Apotheose des Bischofs gedacht war. Der Saal war mit Fresken von Ferraù de Faenza bemalt und stellte eine Schriftrolle und das Portrait aller Pfarrer dar, die die Geschicke der Kirche in Todi leiteten, von San Terenziano (Hl. Terentius) bis hin zu Angelo Cesi. Im selben Stockwerk befanden sich auch die private Kapelle und die Galerie mit einem Fresko des Malers Andrea Polinori mit Szenen aus der Geschichte von Todi. Von hier aus gelangte man in die privaten Salons des Bischofs, die heute als Diözesanbibliothek genutzt werden. Im vierten und letzten Stockwerk befanden sich ausschließlich die Räume der Diener.