Die Kirche, die seit dem dreizehnten Jahrhundert besteht, war zunächst dem Hl Matthäus geweiht und wurde erst ab 1256 dem San Francesco (Hl. Franziskus von Assisi) geweiht, der diese Kirche der Tradition nach häufig besuchte. Ab 1796 wurde das alte Gebäude nach einem Projekt des Architekten Andrea Vici komplett umgebaut. Die mehrjährigen Arbeiten beaufsichtigten auch Giovanni Bettini und Vincenzo Vitali. 1856 wurde das Gebäude wieder für die Öffentlichkeit zugänglich gemacht, aber es fehlte noch die Fassade, die erst 1886 vom Ingenieur Giovanni Bertucci gebaut wurde.
Die drei Eingangstore, die von einfachen Rahmen gesäumt und definiert sind, werden durch eine Stuckverzierung aus fünf Pilastern mit Kapitellen abgerundet.
Der Innenraum der Kirche San Francesco di Foligno ist im neoklassischen Stil gehalten und besteht aus einem einzigen Kirchenschiff, auf dessen beiden Seiten sich vier Kapellen befinden.
Die Apsis ist mit Fresken aus dem achtzehnten Jahrhundert verziert, während die Sakristei und die Kapelle Cappella di S. Matteo die fragmentarische Freskendekoration des vierzehnten Jahrhunderts enthalten.