La chiesa di San Fedele appartiene alla proprietà di Villa Fidelia, vi si accede da Via Centrale Umbra, pochi passi prima dell’ingresso alla Villa, oppure mediante l’accesso secondario che si trova accanto al centro visite. La sua posizione è in asse con il sacello occidentale, quello di Giove, indi per cui è ritenuta un’area sacraria preesistente che potrebbe essere identificata con il tempio della Gens Flavia, voluto da Costantino e innalzato dopo il 326 d. C.
Secondo Taddeo Donnola questo fu il luogo del martirio di San Fedele, santo da cui la chiesa e la Villa prendono il nome, mentre la tradizione vi voleva deposto il corpo di San Felice, patrono di Spello e di Giano dell’Umbria.
Quando l’area di Villa Fidelia fu acquistata dall’ingegnere Decio Costanzi, anche la chiesa subì modifiche ad opera dell’architetto Cesare Bazzani: l’edificio venne reso più corto e vi si costruì una graziosa facciata. Fu riaperto al culto l’11 maggio 1935.
L’interno di San Fedele è mutato rispetto all’origine e oggi si presenta spoglio e malridotto. Nella parete sinistra vi sono segni del distacco di un affresco, mentre in quella opposta vi è un affresco di San Felice del XVI secolo.
Nel 1911 la chiesa, che allora apparteneva al folignate Sante Ubaldi, fu dapprima restaurata e in seguito riaperta al culto; dalle cronache sappiamo che l’evento fu celebrato con una grande processione che, al suono delle campane, arrivò a San Fedele dalla chiesa di San Lorenzo.
Era inoltre costume delle madri recarsi dal santo protettore ad invocare la guarigione per i propri bimbi malati: vi erano infatti conservati numerosi ex voto, testimonianze delle grazie ricevute.
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